Po 10 latach od rozpadu drużyny wszyscy otrzymaliście wiadomość od Jacoba Faulstera, prezesa Nuka-Cola Corporation z prośbą o przyjazd do Atlanty-nowej siedziby Korporacji. Wygląda na to że ma dla was jakieś pilne zadanie i oferuje wysoką nagrodę. Po ponownym spotkaniu i podzieleniu się historiami o waszych wyczynach ruszyliście na spotkanie z prezesem. Jacob bardzo się zmienił – ostatnio widzieliście go jako przerażonego pięciolatka, a teraz mimo młodego wieku jest odpowiedzialnym i energicznym prezesem największej firmy Ameryki. Przeszedł od razu do rzeczy. Jakiś czas temu wysłał ekspedycję do przedwojennego ośrodka badawczego Nuka-Coli daleko na północnym zachodzie. Wiedział tylko że pracowano tam nad nowym smakiem napoju, tzw. “Nuka-Colą Supreme” i że projekt był powiązany z substancjami uzależniającymi. Jednakże zanim ekspedycja zdołała zbadać ośrodek została zaatakowana przez tajemniczego napastnika. Wrodzy żołnierze byli świetnie wyszkoleni i wyposażeni. Nosili również charakterystyczne emblematy – flagę przedwojennych Stanów Zjednoczonych. Ludzie Faulstera nie mieli z nimi szans. Niedługo po tym jak byli zmuszeni uciekać z laboratorium napastnicy wysadzili ośrodek w powietrze i odlecieli Vertibirdem.

Jednak zanim Jacob zdążył wytłumaczyć w czym możecie mu pomóc w budynku rozległ się alarm. Jeden ze strażników szybko ostrzegł że wieżowiec jest atakowany. Miejski garnizon oraz część mieszkańców nagle z niewiadomych powodów chwyciła za broń, opanowała część miasta i przypuściła atak na wieżę. Nie zwlekając pospieszyliście aby pomóc strażnikom w obronie budynku. Przeciwnicy wydawali się być niemalże w transie. W końcu udało wam się odeprzeć atak i odbić zajętą przez wroga dzielnice, ale nie obyło się bez strat. Auto Janusza zostało zniszczone podczas walki, a Keny został ciężko ranny. Najgorsze miało jednak dopiero nadejść. Wkrótce po zakończonej bitwie Jacob Faulster otrzymał raporty od swoich pracowników w innych częściach Stanów. Wygląda na to że podobny scenariusz rozegrał się jednocześnie na terenie całego kraju, nawet na tak odległych terenach jak RNK czy ziemie Legionu. Co więcej jego zwiadowcy w magazynie z którego rozpoczął się atak na Atlantę odnaleźli skrzynię pełną pustych butelek po Nuka-Coli Supreme, której receptury korporacja nawet nie zdołała zdobyć. Chwilę po tym odkryciu drużyna otrzymała ostateczny cios. John otrzymał wiadomość z Canaveral. Podobne ataki miały miejsce w całym jego Imperium. Alabama i Floryda upadła, w Georgii zostało zaledwie kilka ocalałych osad. Canaveral właśnie upadało pod naciskiem jego własnego, oszalałego garnizonu. W akcie desperacji John nakazał zdetonować bazę, aby znajdujące się tam rakiety i technologia nie wpadły w ręce wroga.

Faulsterowi dzięki kamerom udało się namierzyć mały magazyn niedaleko za miastem z którego nadeszła dostawa tajemniczej Nuka-Coli, wyruszyliście więc go zbadać w poszukiwaniu informacji. Spotkaliście tam trójkę uzbrojonych mężczyzn z wytatuowanymi flagami Starego Świata. Próbowaliście przesłuchać jednego z nich, ale ten popełnił samobójstwo za pomocą wszczepionej w kość policzkową kapsułki z cyjankiem zanim zdołaliście cokolwiek z niego wydusić. Zdobyliście za to ciężko zabezpieczony dysk z danymi, który zabraliście z powrotem do wieżowca.

Tam po naradzie ze swoimi doradcami Jacob przedstawił wam wasze kolejne zadanie. Kimkolwiek jest wasz przeciwnik jest zdecydowanie zbyt potężny abyście mogli stawić mu czoła samemu. Przedstawił wam akta 6 niezwykłych osób które korporacja niegdyś chciała zrekrutować w charakterze agentów. W czasie kiedy jego naukowcy zajmą się rozkodowywaniem dysku i badaniem resztek zawartych w butelkach po Nuka-Coli Supreme waszym zadaniem jest utworzyć drużynę gotową rzucić wyzwanie tajemniczemu wrogowi. Od was zależy kogo i ile osób zrekrutujecie, ale pamiętajcie że każdy z 6 kandydatów ma własne przekonania i moralność, każdego musicie też jakoś namówić do przyłączenia się do was. Większa grupa oznacza większą siłę i możliwości, ale również więcej problemów i konfliktów wewnętrznych. Wybór należy do was.

Akta-Billy Jackson
Akta-Nemo
Akta-Sir Parvus
Akta-Szop
Akta-Dr Clingman
Akta-Marcus Sharp

Wasza przygoda zaczęła się zwyczajnie: spotkaniem w barze i prostym zleceniem w celu zarobienia odrobiny kapsli. Szybko jednak wplątaliście się w wir wydarzeń, których zwieńczeniem było odtworzenie przedwojennej Nuka-Cola Corporation z pomocą organizacji znanej jako Nuklearni Kapłani. Po tym wasza drużyna się rozstała – John i Keny zostali na Słonecznych Pustkowiach aby dalej rozwijać swoje nowo powstałe imperium, a reszta odeszła w swoją stronę. Przez następne 10 lat Nuka-Cola Corporation dynamicznie się rozwijało, zakładając placówki w tak odległych miejscach jak Republika Nowej Kalifornii. Nuka-Cola ponownie stała się najpopularniejszym napojem Ameryki, a produkująca ją firma bogatym i wpływowym graczem na arenie powojennych Stanów.